Университеттин илимий ишмердүүлүгүнө төмөнкү структуралык курам кирет: Илимий-техникалык жана Илимий-методикалык кеңештер, Илим жана аспирантура бөлүмү, Диссертациалык кеңеш, «Инновациялык технологиялар» илим-изилдөө институту, «Илим. Билим. Техника» эл-аралык илимий журналынын редакциясы, факультеттер, «Табигый таш», «Альтерэнерго», «Формалуу кийим», «Өткөөл экономика», «Комплекстүү бирикмелер химиясы», «Жогорку мектептин педагогикасы жана усулу» жана «Өзгөчө кырдаалдар медицинасы» илим-изилдөө борборлору, бөлүмдөр, кафедралар жана илимий лабораториялар.